La citología oftalmológica es una técnica diagnóstica basada en el estudio a nivel microscópico de células y microorganismos recolectados en diferentes localizaciones del ojo según el caso.
La citología ocular es una herramienta fundamental en el diagnóstico de enfermedades de la superficie ocular ya que permite determinar el origen del proceso y así aplicar la terapia más adaptada a cada caso. En muchas ocasiones las muestras pueden ser obtenidas de la superficie ocular con hisopo o con cepillo citológico pero en determinados casos son precisas punciones con aguja fina (PAF) para tomar las células que serán estudiadas bajo el microscopio.